单细胞AB-seq测序
- DXB-003
- 云序生物
- 上海市
- 三个月内
- 按需定制
- 议价
- 2022-07-21 14:31:55
上海云序生物科技有限公司
一键申请试用
咨询
加入意向单
联系方式
单细胞内的蛋白质组学研究越来越受到研究者的重视，同时将蛋白组学和基因组学研究结合在一起进行多维度单细胞信息解读，不仅能够更好地观察细胞之间的异质性，同时也能够更清楚地识别特定细胞及其功能。BD Abseq 与BD RhapsodyTM 高通量单细胞捕获系统结合使用的方式，能够使研究人员同时分析数千个单细胞中的 RNA 和蛋白质，完整揭示出生物学系统中基因和蛋白质的作用。
技术简介：
AbSeq是利用特异性抗体核酸偶联结构，将蛋白表达量转化为核酸含量，然后通过高通量测序手段检测蛋白含量。
抗体核酸偶联结构图
技术流程：
BD Rhapsody™融合了 WTA 和 Abseq 两种单细胞检测技术，将蛋白组和转录组的检测过程在单细胞水平很好地进行了融合。细胞经过 BD AbSeq Ab-oligos 标记后，通过 BD Rhapsody™ 微孔沉降技术捕获单细胞全转录组 mRNA 和 Ab-oligo。然后，利用文库扩增试剂对同一样本产生平行的 RNA 和 BD AbSeq 测序文库。经过高通量测序后获得 RNA 和蛋白表达的数据，并使用特定分析软件 SeqGeqTM 进行数据分析。
实验流程图
技术优势：
1）可对同一个样本，在一次实验中得到高通量mRNA 和 蛋白表达量数据
2）蛋白的表达量数据可弥补mRNA中不能检测到的信息
3）依据蛋白的表达量数据更加准确可靠的鉴定细胞亚群
4）目前 BD 公司推出的 Abseq 抗体约有400余种（人和小鼠），可以满足大部分实验需求。
应用方向：
- 肿瘤异质性
- 组织发育机制
- 治疗干预反应
- 生物标志物发现
案例解析：
案例：通过蛋白- RNA单细胞分析发现CD80和CD86作为调节性T细胞的活化标志物
原文： Discovery of CD80 and CD86 as recent activation markers on regulatory T cells by protein-RNA single-cell analysis
期刊：Genome Medicine(2020) 影响因子：10.7
本文用多组学方法在mRNA水平上对397个基因的单细胞表达进行了量化，并使用寡聚偶联抗体(AbSeq)对43,656个从血液中分离出来的初级CD4+ T细胞和31,907个从血液中分离出来的CD45+细胞以及匹配的十二指肠活检中的68个蛋白质进行了定量。探讨了这种靶向scRNA-seq方法在分析人类免疫细胞群异质性和识别功能性T细胞分化轨迹方面的敏感性。这种多组学方法提供的敏感性识别了CD4+ treg表面的B7分子CD80和CD86的表达，进一步证明了B7表达有潜力识别循环中新近激活的T细胞。本研究中描述的转录组和蛋白质组杂交技术提供了一种具有成本效益的解决方案，以极高的分辨率来分析免疫细胞群体的异质性。出乎意料的是，CD80和CD86通常在抗原呈递细胞上表达，但在一个活化的treg亚群上被检测到，这表明这些共刺激分子在调节CD4+ T细胞应答的动态中发挥了作用。
