单细胞测序 | 如何解决单细胞测序前的细胞质控?
单细胞测序(single cell sequencing)是指先分离纯化单个细胞,并提取该细胞的DNA或RNA进行扩增后测序的技术。该技术广泛应用于肿瘤、微生物学、神经科学等重要生命科学领域,单细胞测序技术也逐渐成为了生命科学研究的热点。相比于宏观组织样品的测序,单细胞测序对于细胞和组织的异质性具有更加明确的分辩,当然,难度也相对更高。
单细胞测序结合生命科学研究领域的应用,已逐步向着更高的分辩能力、灵敏度、和更多的维度迈进。
什么是单细胞测序?
单细胞测序是基于高通量测序(NGS)方法,可检测单细胞基因组、单细胞转录组、单细胞表观基因组,提供细胞间差异的高分辨率视图,从分子水平揭示细胞奥秘。
样本要求
01、 样本总量
制备成单细胞悬浮液,一个样本的细胞起始量需大于1x105个。
02、 样品浓度
最终上样前细胞浓度在700-1200 cells/μL。
03、 细胞活性
活细胞比率在85%以上。
04、 细胞大小
直径小于40μm。
其它要求
1-细胞培养基及缓冲液不能含有Ca2+和Mg2+等影响酶活性的物质。
2-组织需解离成单细胞悬液,植物细胞需制成原生质体。
为解决细胞计数准确性以及人工复核难的问题,博大博聚特推出一款“全自动荧光细胞分析仪(JSY-FL-047)”。仪器参照血球计数板计数规则,可实现人工比对仪器的计数结果。具有单细胞计数模式。为实验用户提供更可靠更高效的实验解决方案。
全自动荧光细胞分析仪(JSY-FL-047)
1- 单细胞计数功能
仪器可识别出样本中单个细胞所占比例和聚团细胞所占比例,适合单细胞测序前对单个细胞的质控。
计数结果包含:总细胞数量、总细胞浓度、团聚活细胞团数(浓度-比率)、单个活细胞数量(浓度-比率)、总死细胞数量(浓度-比率)。
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