植物基因组DNA提取及其检测
植物基因组DNA提取及其检测
一、背景知识
在分析和研究DNA时,提取和纯化DNA是第一步操作,也是实验的基础。对于植物来说,DNA主要存在于细胞核内,核内DNA占整个细胞DNA量的90%以上;核外的DNA主要有线粒体DNA和叶绿体DNA。所有植物基因组DNA的获得都包括两个步骤:一是裂解细胞和溶解DNA;二是通过一种或多种酶学或化学的方法除去蛋白质、RNA和其他大分子杂质。
不同植物、同种生物的不同种类、同一种类的不同组织器官因其细胞结构和所含成分不同,基因组DNA提取方法既有共同的操作方法,也有特殊的处理步骤。在提取某些特殊组织器官DNA时,需要参考前人经验采用相应的改良提取方法,从而获得高质量的可用DNA大分子。如从富含多酚和多糖的组织中提取DNA,应增加除去多酚和多糖的实验步骤,以免残留物抑制后续的酶切、PCR等操作。
不同的实验目的对提取的DNA质量要求也不相同。构建基因组文库、基因分型、RFLP(限制性片段长度多态性)和Southern杂交等实验对初始DNA长度要求较大,而普通PCR反应则要求较低。植物基因组DNA在提取过程中会发生机械断裂,产生不同大小的片段,因此,应该尽量减少酚/氯仿抽提次数、混匀过程要轻缓,以保证得到较为完整的基因组DNA。
目前,CTAB法是植物基因组DNA提取的常用方法之一,是由Murray 和Thompson(1980)修改而成的简便方法。后续一些研究者对该法进行了改进和发展。
二、实验原理
CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7 mol/L NaCl)是可溶的,当溶液盐浓度降低到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB–核酸的复合物与蛋白、多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA,而CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去。
在CTAB提取缓冲液中,Tris–HCl (pH 8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2+或Mn2+,抑制DNase活性;NaCl 提供一个高盐环境,使CTAB–核酸复合物充分溶解,存在于液相中;CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;β–巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除。
三、实验目的
1. 掌握核酸提取的原理和方法。
2. 认识核酸的基本性质以及操作核酸的基本步骤。
3. 掌握水平凝胶电泳的原理及注意事项。
4. 后续实验准备样品。
四、实验材料
小麦、玉米和水稻等植物的幼嫩叶片。可提前4~7 d在培养皿或育苗盘中播种、育苗,实验前剪取新鲜叶片。
五、试剂与仪器
液氮、CTAB提取缓冲液、氯仿/异戊醇(24∶1)、异丙醇、70%乙醇、TE 缓冲液、灭菌ddH2O、琼脂糖、6 ×上样缓冲液、50 × TAE电泳缓冲液、溴化乙啶EB。
研钵、剪刀、微量移液器、灭菌1.5 mL离心管、灭菌枪头、锥形瓶、量筒。
台式离心机、水浴锅、电子天平、微波炉、电泳槽、电泳仪、紫外成像仪。
六、实验步骤及其解析
(一)植物基因组DNA提取
1.将1 g左右新鲜叶片剪成1~2 cm片段,搁置于研钵中,加入约50 mL的液氮,轻轻捣碎叶片,待液氮将要挥发完时,迅速研磨成白绿色粉末,置入1.5 mL 离心管中。
不同植物、不同组织、不同年龄的材料提取DNA产率不同,植物幼嫩组织产率高。
尽量采用新鲜材料。若是–80℃冰箱保存的样品,研磨前应避免样品化冻变软。
100 mg新鲜植物幼嫩组织可获得5~15 μg DNA。适量分装样品粉末到离心管。
研磨得越细越好,以便很好地解离细胞、破碎细胞壁,并提高DNA产率。
液氮尽量一次加足。若需第二次加液氮,不要让飞浮起的粉末污染了液氮勺。
快速分装。加CTAB提取缓冲液前,粉末不能化冻变成绿色泥状物。将粉末从研钵转移到离心管前,可将勺和离心管在液氮预先冷冻一下。
2.马上加入600 μL预热的CTAB提取缓冲液(至少预热30 min),混匀,65℃水浴提取1 h,其中每10 min颠倒混匀1次。
样品重量增加,应相应地增加提取缓冲液的用量。对于较老的植物组织,可以适当加大提取液中β-巯基乙醇的用量,如2.5%~3.0%,从而减轻褐变。
预热可使CTAB均匀分布,并使样品粉末快速溶于提取液。
水浴振荡提取可以促进细胞裂解。不要让离心管盖崩开。
剧烈振荡会打断溶液中分子质量高的DNA。
如需得到无RNA的DNA,也可以在水浴后加入20 μL 10 mg/mL RNase A,室温放置2~5 min。
3.取出离心管,冰浴冷却5 min 后,加入等体积氯仿/异戊醇(24∶1)抽提液,轻轻颠倒混匀,冰上静置10 min。
冰浴冷却是为了下一步加入抽提液时降低氯仿的挥发。应在通风橱内加入抽提液。
有的实验使用苯酚/氯仿/异戊醇(25∶24∶1)。苯酚能有效地变性蛋白质,并能溶解变性蛋白质;氯仿也是蛋白质变性剂,但加入氯仿的主要原因是增加抽提液比重,使得酚/氯仿始终在下层的有机相,方便水相的回收;异戊醇可防止混合时产生泡沫,更好地形成水相和有机相之间的界面。
充分混合后静置有利于水相和有机相的分层。上层水溶液(水相)含有DNA,下层(有机相)主要是氯仿,大多数的变性蛋白质处于两相之间的界面上。
混匀过程要轻柔舒缓,以免DNA发生机械断裂。
4.室温6 000 r/min离心10 min,用剪掉尖头的枪头小心吸出上清液500 μL(淡黄色或无色),放入新离心管中。
剪掉枪头尖可以减缓吸取时的抽力,避免DNA断裂和吸入有机相物质。
吸取动作要细心缓慢,不要吸得过多过快(可分几次吸取),避免振荡,以免吸取了水相和有机相中间的杂质,影响抽提纯化效果。
整个实验操作过程中,应戴手套和使用灭菌的离心管和枪头,避免核酸酶污染。
5.加入等体积的异丙醇,上、下颠倒混匀数次,即出现絮状DNA沉淀。室温下8 000 r/min离心10 min。
用乙醇可使DNA溶液中的DNA沉淀,是因为乙醇可以使DNA脱水。
乙醇分子含1个羟基,异丙醇2个羟基,因离心管体积所限,故用等体积异丙醇,但异丙醇的挥发性小于乙醇。
若溶液中DNA含量较高,基因组DNA大片段在乙醇或异丙醇作用下,沉淀形成纤维状絮团漂浮。
若溶液中DNA含量较低,会观察到管中含有白色悬浮的丝状或颗粒状DNA(甚至看不到沉淀),可使用预冷的异丙醇,或加入异丙醇后于-20℃冰箱放置20 min离心。
异丙醇(乙醇)沉淀DNA可以有效地去除残留的苯酚、氯仿和一些离子。
混匀过程要轻柔舒缓,以免DNA发生机械断裂。
6.倒掉上清液,加入300 μL TE 缓冲液,DNA能很快溶解。
可将上一步的DNA絮团捞出,在干净吸水纸上吸干后转入含300 μL TE的离心管。
DNA沉淀可溶于水或100 mmol/L TE(pH 8.0)溶液,是因为 DNA双螺旋外侧是亲水的磷酸基团和戊糖残基。
65℃水浴15 min可以帮助DNA沉淀溶解。
7.先后加入1/10体积的3 mol/L NaAc和2倍体积的预冷无水乙醇,温和颠倒混匀,放置20 min,使DNA形成絮状沉淀。
因上一步获得的DNA水溶液中不存在高浓度的氯化钠等盐离子,所以该步骤加入1/10体积的3 mol/L NaAc溶液,以中和DNA所带负电荷,使得DNA易于沉淀。
混匀过程要轻柔舒缓,以免DNA发生机械断裂。整个实验操作得当,通常可以得到长度50~100 kb的DNA。
将乙醇预冷可以加快沉淀进程。乙醇沉淀DNA有助于提高DNA浓度、去除盐离子。
8.室温下6 000 r/min离心5 min。
也可将上一步的絮状物用枪头(玻璃棒、牙签)挑至新离心管(事先将新管中放入500 μL 70%乙醇,便于释放絮团)后再离心。
离心速度过高和时间过长,导致沉淀块致密,会加大后续沉淀块溶解的难度。
9.用70%乙醇漂洗沉淀表面和管壁两次,将离心管倒置在吸水纸上空气干燥。
漂洗过程中,倒出70%乙醇时避免让DNA沉淀随之流走。
漂洗时若沉淀悬浮起来,需要离心再倒掉70%乙醇。
倒置离心管时,不要让沉淀块滑到吸水纸上。
尽量让沉淀表面的乙醇挥发干净,否则影响DNA溶解和后续实验。
过分干燥的沉淀块比较难溶于水或TE缓冲液。
10.加100~200 μL 100 mmol/L pH8.0 TER(含RNase A 10 mg/mL)溶解,-20 ℃保存。
绝大部分的RNA可通过RNase A除去。如在第2步的CTAB提取缓冲液中加入了RNase A,就可以只用100 mmol/L pH8.0 TE溶解。
建议使用pH 8.0 TE溶解和保存DNA。DNA在弱碱性溶液最稳定。
也可溶于200 μL灭菌的ddH2O,但ddH2O因溶解了空气中的二氧化碳,而呈弱酸性(pH 6.8左右),不利于中长期保存。
(二)测定DNA浓度和纯度
1.取DNA溶液5 μL,稀释200倍。
取DNA溶液时,要混匀DNA溶液,可以用枪头轻轻搅拌均匀。
2.用紫外分光光度计在230nm、260 nm、280nm和310nm波长下测量吸光值。其中,OD260用于估算样品中DNA的浓度,1个OD260相当于50μg/mL双链DNA。
样品浓度(mg/mL)=OD260×稀释倍数×50/1000
而OD260/OD280与OD260/OD230用于估计DNA纯度。对于较纯的DNA样品,OD260/OD280≈1.8,OD260/OD230>2。若OD260/OD280>1.8,说明有RNA污染;若OD260/OD280<1.8,说明有蛋白质污染。
核酸所含嘌呤和嘧啶分子具有共轭双键,在260 nm波长处有最大吸收峰。蛋白在280 nm波长处有最大吸收峰。OD230来评估样品中是否存在一些污染物,如碳水化合物、多肽、苯酚等。OD310为背景吸收值。
(三)琼脂糖水平电泳检测
1.取250 mL锥形瓶,用电子天平称取琼脂糖0.5 g。
2.加入1 × TAE电泳缓冲液50 mL (即1 %琼脂糖),摇匀。
3.用微波炉熔化,混匀。
忌猛火过长时间加热,避免暴沸和溢出。
加热过程中可暂停,戴厚线手套小心摇匀。熔化好的琼脂糖溶液澄清透明。
4.准备胶板,插上梳子。待溶液冷却至60℃左右时,向锥形瓶中加入2 μL EB(或其他荧光染料),摇匀,酌情将胶倒入制胶架。冷却凝固30 min后,拔出梳子。
5.置胶板于微型电泳槽后,倒入1 × TAE电泳缓冲液。
电泳缓冲液刚好没过凝胶表面1 mm为宜。
6.取2~5 μL DNA溶液与1~2 μL 6×上样缓冲液混合均匀,点样,电泳(55 V / 40 min)。
取DNA溶液时,要混匀DNA溶液,可以用枪头轻轻地搅拌均匀。
新手点样时,为防止手抖动,可将点样的手肘支于桌面,或用另一只手握住点样手腕。
点样时,枪头尖插到点样孔中下部,使点样液缓慢排出。枪头拔出液面时才松开拇指。
琼脂糖凝胶的点样孔一侧靠近黑色的负极。
7.紫外成像并分析。
七、实验报告
1. 预习作业
从植物细胞结构上看,想要提取植物基因组DNA应该采取哪些步骤?
2.结果分析与讨论
(1)附上琼脂糖凝胶电泳检测图(应标注DNA marker的名称及其片段大小、各泳道的材料名称),DNA条带是单一的吗?其位置在哪里?如果有弥散拖尾现象说明了什么?
(2)根据电泳图谱和OD数据,判断所提取的DNA是否满足后续实验要求。
八、思考题
1.为避免电泳检测时出现多条带和弥散现象,DNA提取过程应注意哪些事项?
2.CTAB提取缓冲液的主要成分有哪些?它们的作用分别是什么?
3.为什么上清液中加入2倍体积乙醇能够沉淀DNA?DNA沉淀为什么能够溶于水?
4.琼脂糖凝胶电泳检测DNA时,DNA为什么从负极向正极泳动?
九、研究案例
1.适用于大规模转基因作物PCR检测的简易DNA提取(钟罗宝和陈谷,2008)
该研究以转基因拟南芥叶片为样本,将改进碱裂解法作为一种简易有效的DNA提取法,以应用于大规模转基因作物PCR检测中。将碱裂解法、SDS法和CTAB法提取的基因组DNA电泳比较,结果表明,碱裂解法DNA含量很少,图谱中没有条带,SDS法DNA的质和量比碱裂解法大幅提高,但是CTAB法DNA质和量是最好的。但三种方法提取的DNA就能满足PCR扩增的要求。
2.对小麦幼叶DNA微量快速提取方法的改进(董建力等,2007)
该研究为满足对大批量材料进行分子标记检测的需要,以小麦幼叶为材料,对常规的CTAB法提取DNA方法进行了简化和修改。结果表明,从DNA样品的0.8%琼脂糖凝胶电泳图谱看出,常规提取法(液氮研磨、NaCl)、改进提取法Ⅰ(液氮研磨、用KCl代替NaCl)和改进提取法Ⅱ(不用液氮研磨、用KCl代替NaCl)都能得到条带清晰、亮度相近的DNA片断,说明这三种方法提取的DNA质量都较好;改进法的DNA(第4泳道和第6泳道)降解程度大于常规法,但也能满足后续分子标记的需求。由于该研究的DNA样品未用RNase处理,因此底部有少量的RNA和杂质存在。
十、附录
1.CTAB提取缓冲液:含有100 mmol/L Tris–HCl (pH 8.0)、50 mmol/L EDTA (pH 8.0)、500 mmol/L NaCl、2% CTAB、0.1% β–巯基乙醇。
配制方法:将20 g CTAB和29.22 g NaCl溶于750 mL ddH2O,再依次加入1 mol/L Tris–HCl(pH 8.0)100 mL,0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)100 mL,10 mL β–巯基乙醇,混匀,定容至1 L。高压湿热灭菌20 min,4℃保存备用。
2.1 × TE缓冲液:含有10 mmol/L Tris–HCl (pH 8.0)、1 mmol/L EDTA (pH 8.0)。
配制方法:取1 mol/L Tris–HCl(pH 8.0)1 mL,0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)0.2 mL,再加ddH2O至100 mL,混匀。高压湿热灭菌20 min,4℃保存备用。
3.氯仿/异戊醇抽提液:氯仿和异戊醇按照24∶1的比例混合。
4.50 × TAE电泳缓冲液
成分 |
配制1 L溶液各成分的用量 |
2 mol/L Tris |
242g |
1 mol/L 乙酸 |
57.1 mL的冰乙酸(17.4 mol/L) |
100 mmol/L EDTA |
200 mL的0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) |
ddH2O |
补至1 L |
5.6 ×上样缓冲液(室温贮存)
成分及终浓度 |
配制10 mL溶液各成分用量 |
0.15%溴酚蓝 |
1.5 mL 1%溴酚蓝 |
5 mmol/L EDTA |
100 μL 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0) |
15%聚蔗糖(400型) |
1.5 g |
0.15%二甲苯青FF |
1.5 mL 1%二甲苯青FF |
ddH2O |
补至10 mL |
6.1 mol/L Tris–HCl(pH 8.0)
配制方法:将121.1g Tris溶于800 mL ddH2O,用4 mol/L浓盐酸调节pH至8.0,定容至1 L。高压湿热灭菌20 min,4℃保存备用。
市售“发烟”盐酸(浓度为37%,密度1.179g/mL)为12 mol/L。高浓度盐酸易挥发,挥发出来的HCl气体在空气中与水蒸气结合形成雾。为使用方便,可稀释3~6倍。7.0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)
配制方法:在800mL ddH2O中加入186.1g二水乙二胺四乙酸钠(EDTA–Na2·2H2O),充分搅拌,这时溶液为乳白色,加10 mol/L NaOH调解pH至8.0,这时溶液颜色逐渐变为澄清。最后定容至1L。高压灭菌,室温保存。
十一、拓展知识
1.关于凝胶电泳中溴化乙啶(EB)在荧光灯下的成像原理
溴化乙啶是一种高度灵敏的荧光染色剂,用于观察琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶中的DNA。溴化乙啶用标准302 nm 紫外光透射仪激发并放射出橙红色信号,可用带CCD 成像头的凝胶成像处理系统拍摄。
观察琼脂糖凝胶中DNA最常用的方法是利用荧光染料溴化乙啶进行染色,溴化乙啶含有一个可以嵌入DNA堆积碱基之间的三环平面基团。它与DNA的结合几乎没有碱基序列特异性。在高离子强度的饱和溶液中,大约每2.5个碱基插入一个溴化乙啶分子。当染料分子插入后,其平面基团与螺旋的轴线垂直并通过范德华力与上下碱基相互作用。这个基团的固定位置及其与碱基的密切接近,导致与DNA结合的染料呈现荧光,其荧光产率比游离溶液中染料有所增加。DNA吸收254 nm处的紫外辐射并传递给染料,而被结合的染料本身吸收302 nm和366 nm的光辐射。这两种情况下,被吸收的能量在可见光谱红橙区的590 nm处重新发射出来。由于溴化乙啶–DNA复合物的荧光产率比没有结合DNA的染料高出20~30倍,所以当凝胶中含有游离的溴化乙啶(0.5 μg/mL)时,可以检测到少至10 ng的DNA条带。
溴化乙啶可以用来检测单链或双链核酸(DNA或RNA)。但是染料对单链核酸的亲和力相对较小,所以其荧光产率也相对较低。事实上,大多数对单链DNA或RNA染色的荧光是通过染料结合到分子内形成较短的链内螺旋产生的。
2.SYBR Green I在凝胶电泳中的应用
SYBR Green I是一种结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料,最大吸收波长约为497 nm,发射波长最大约为520 nm。在游离状态下,SYBR Green I发出微弱的荧光,但一旦与双链DNA结合后,荧光信号会增强800~1 000倍。因此,SYBR Green I的荧光信号强度与双链DNA的数量相关,从而可根据荧光信号强度检测出PCR体系存在的双链DNA数量。
SYBR Green I灵敏度高,至少可检出20 pg DNA,高于EB染色法25~100倍。用SYBR Green I染色的凝胶样品荧光信号强,背景信号低,适用于琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶电泳、脉冲电场凝胶电泳和毛细管电泳等多种凝胶电泳。SYBR Green I对分子生物学中常用的酶(如:Taq 酶、逆转录酶、内切酶、T4连接酶等)没有抑制作用。另外,与EB相比,其诱变能力大大降低。
(1)工作液的配制:用电泳缓冲液将10 000×的SYBR GreenⅠ稀释100倍,即为SYBR GreenⅠ工作液。SYBR GreenⅠ工作液可以置2~8℃冷藏1个月以上。
(2)制胶:按常规方法制胶,不含任何染料和EB。
(3)样品染色:向分析样品中加入SYBR GreenⅠ工作液和载样缓冲液,室温放置10 min,使SYBR GreenⅠ与样品中DNA充分结合。SYBR GreenⅠ工作液加入量为总上样量的1/10。
(4)DNA marker染色:将5 μL DNA marker和1 μLSYBR GreenⅠ工作液混匀,室温放置5 min,使SYBR GreenⅠ与DNA充分结合。
3.DNA提取常见问题分析
(1)DNA样品不纯,抑制后续酶解和PCR反应。
原因 |
解决办法 |
DNA中含有蛋白、多糖、多酚类杂质 |
重新氯仿/异戊醇(24∶1)抽提,纯化DNA |
DNA在溶解前有酒精残留,导致酒精抑制后续酶解反应 |
重新沉淀DNA,并让酒精充分挥发彻底 |
DNA中残留有金属离子 |
增加70%乙醇洗涤的次数(2~3次) |
(2)DNA完全或部分降解。
原因 |
解决办法 |
材料不新鲜或反复冻融 |
尽量取新鲜材料,低温保存材料避免反复冻融 |
未能很好地抑制内源核酸酶的活性 |
液氮研磨后,应在化冻前加入裂解缓冲液;采用内源核酸酶含量丰富的材料时,增加裂解液中螯合剂的含量 |
提取过程操作过于剧烈,DNA被机械打断 |
细胞裂解后的后续操作应尽量轻柔 |
外源核酸酶污染 |
所有试剂用无菌ddH2O配制,耗材经高温灭菌 |
DNA溶液反复冻融 |
将DNA溶液分装保存于多个离心管,避免反复冻融 |
(3)DNA提取量少、浓度低。
原因 |
解决办法 |
实验材料不佳或量少 |
尽量选用新鲜(幼嫩)的材料 |
破壁或裂解不充分 |
研磨充分;高温裂解时,时间适当延长 |
沉淀不完全 |
预冷异丙醇;低温沉淀;延长沉淀时间 |
洗涤时DNA沉淀部分丢失 |
洗涤时,最好用枪头将洗涤液吸出,勿倾倒 |
4.DNA电泳常见问题分析
(1)DNA条带模糊。
原因 |
解决办法 |
DNA降解 |
避免核酸酶污染 |
电泳缓冲液陈旧 |
电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲能力减弱,从而影响电泳效果。建议经常更换电泳缓冲液 |
所用电泳条件不合适 |
电泳时电压不应超过20 V/cm,温度<30℃;巨大DNA链电泳,温度应<15℃;核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力 |
DNA上样量过多 |
减少凝胶中DNA上样量 |
DNA样含盐过高 |
电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐 |
有蛋白污染 |
电泳前酚抽提去除蛋白 |
DNA变性 |
电泳前勿加热,用20 mmol/L NaCl buffer稀释DNA |
(2)不规则DNA条带迁移。
原因 |
解决办法 |
对于λ/Hind III片段cos位点复性 |
电泳前于65℃加热DNA 5 min,然后在冰上冷却5 min |
电泳条件不合适 |
电泳电压不超过20V/cm;温度<30℃;经常更换电泳缓冲液 |
DNA变性 |
以20 mmol/L NaCl buffer稀释DNA,电泳前勿加热 |
(3)带弱或无DNA条带。
原因 |
解决办法 |
DNA的上样量不够 |
增加DNA的上样量;聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂糖电泳灵敏度稍高,上样量可适当降低 |
DNA降解 |
避免DNA的核酸酶污染 |
DNA走出凝胶 |
缩短电泳时间,降低电压,增强凝胶浓度 |
对于EB染色的DNA,所用光源不合适 |
应用短波长(254nm)的紫外光源 |
(4)DNA条带缺失。
原因 |
解决办法 |
小DNA带走出凝胶 |
缩短电泳时间,降低电压,增强凝胶浓度 |
分子大小相近DNA带不易分辨 |
增加电泳时间,核准正确的凝胶浓度 |
DNA变性 |
电泳前勿高温加热DNA链,以20 mmol/L NaCl b buffer稀释DNA |
DNA分子质量巨大 |
常规凝胶电泳不合适,在脉冲凝胶电泳上分析 |
品牌 |
货号 |
中文名 |
JSENB |
JS0700 |
苯酚:氯仿:异戊醇25:24:1,PH≥7.8 |
JSENB |
JS0900 |
苯酚:氯仿:异戊醇25:24:1,PH<5.2 |
其他农学院频繁性实验技术
第一部分 核酸的提取和检测
1. 植物基因组DNA提取及其检测
2. 细菌质粒DNA的提取和电泳检测
3. 植物总RNA提取及其检测
第二部分 蛋白质提取、纯化和检测
1. 重组蛋白的提取和纯化
2. 植物总蛋白的提取和电泳检测
3. Western印迹法
- 目的基因的检测及其表达分析
1. PCR扩增目的基因片段
2. 基因表达部位的原位杂交检测
3. 亚细胞定位实验
第四部分 重组质粒的构建及其遗传转化
1. DNA片段的回收和连接
2. 重组子的转化和蓝白斑筛选
3. 重组质粒的酶切验证
4. 农杆菌蘸花法转化拟南芥
第五部分 分子杂交和互作相关技术
1. 利用酵母双杂交技术筛选靶蛋白的互作蛋白
2. 融合蛋白沉降技术分析蛋白质的相互作用
3. 酵母单杂交系统
4. 电泳迁移率实验—检测蛋白质-DNA结合相互作用
5. 染色质免疫共沉淀
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