八月顶刊文献速递｜单细胞转录组系列

为帮忙大家更快了解最新科研进展，掌握科研热点，扩展科研思路，伯豪生物特此推出最新顶刊文献速递系列推文。本期是2024年8月最新顶刊发表的单细胞转录组相关文献集萃！

顶刊文献一：Cell丨解密脉络丛与免疫细胞在神经炎症中的协同作用

文章标题：The choroid plexus synergizes with immune cells during neuroinflammation

期刊：Cell

影响因子：45.5

文章摘要：脉络丛（Choroid plexus，ChP）是重要的脑屏障和脑脊液 (CSF) 的来源。该研究使用小鼠的纵向双光子成像和单细胞转录组学来阐明 ChP 调节脑炎症的机制。研究使用脑室内注射脂多糖 (LPS) 来模拟小鼠的脑膜炎，并观察到中性粒细胞和单核细胞在 ChP 基质中积聚并穿过上皮屏障进入脑脊液。从外周双向募集单核细胞以及从脑脊液向 ChP 募集巨噬细胞有助于消除中性粒细胞并修复屏障。单细胞转录组分析详细描述了伴随这一过程的分子步骤，并揭示了 ChP 上皮细胞暂时特化以滋养免疫细胞，协调它们的募集、存活和分化以及调节控制 ChP 脑屏障通透性的紧密连接。

顶刊文献二：胶质母细胞瘤中的颅脑功能性淋巴单位

文章标题：Cranioencephalic functional lymphoid units in glioblastoma

期刊：Nature Medicine

影响因子：58.7 

文章摘要：该研究利用来自患有胶质母细胞瘤或非恶性颅内疾病的患者的临床细胞和组织标本，发现与未经治疗的胶质母细胞瘤肿瘤相比，颅骨（CB）骨髓在初次诊断时就含有活跃的淋巴细胞群。临床和解剖成像、单细胞转录组测序和免疫细胞分析以及肿瘤反应性的量化，确定了CB中的CD8+ T细胞克隆型，这些克隆型也在肿瘤中发现。这些克隆型的特征是植根于整个T细胞发育谱的急性和持久的抗肿瘤反应。与远端骨髓相比，肿瘤近端的CB表达淋巴迁移标记物S1PR1的肿瘤反应性CD8+效应T细胞占比增加。总之，该研究探索了CB骨髓内的免疫细胞库，以评估它们与疾病相关功能。

顶刊文献三：整合人类大脑区域单细胞转录组的脑细胞图谱

文章标题：A brain cell atlas integrating single-cell transcriptomes across human brain regions

期刊：Nature Medicine

影响因子：58.7

文章摘要：该研究通过整合来自 70 项人类和 103 项小鼠大脑研究的单细胞数据，涵盖大脑各区域主要发育阶段的数据，覆盖了来自健康和和患病组织的超过 2630 万个细胞或细胞核，展示了一个全面的脑细胞参考图谱。使用基于机器学习的算法，脑细胞图谱提供了一个一致的细胞类型注释，并展示了人脑中假定的神经祖细胞和PCDH9 high小胶质细胞的细胞亚群。研究证明了海马和前额皮质之间PCDH 9 high小胶质细胞的基因调控差异，并阐明了细胞间通讯网络。脑细胞图谱提供了图谱级别的综合资源，用于比较人类细胞图谱中不同环境和条件下的脑细胞。

顶刊文献四：RAS改变衰老状态并影响肿瘤的发生

文章标题：Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation

期刊：Nature

影响因子：50.5

文章摘要：致癌RAS诱导的衰老（OIS）是一种与癌前病变相关的肿瘤抑制机制。这种表型通常需要高水平的致癌应激，但较低致癌剂量引起的表型尚不清楚。该研究开发了体外和体内致癌RAS剂量递增模型，，揭示了RAS剂量驱动的下游表型的非线性连续体。单细胞RNA测序分析显示，不同的肝细胞簇具有典型的OIS或祖细胞样特征。可识别两种不同的肿瘤类型：早发性侵袭性未分化性和晚发性分化性肝细胞癌。每种小鼠肿瘤类型的分子特征与不同的祖细胞特征相关，并在不同的人类肝细胞癌亚类中富集。总之，该研究结果证实了致癌剂量驱动的OIS，协调了早期肿瘤发生中的衰老和肿瘤起始表型。