全转录组是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本的总和，包括mRNA和所有的non-coding RNA。全转录组测序应用RNA-Seq技术，

通过构建两种文库（small RNA文库和去rRNA的链特异性文库），对四种RNA（miRNA，lncRNA，mRNA，circRNA）的表达及调控关系进行分析。

同时分析miRNA，lncRNA，mRNA，circRNA四种RNA的表达及调控关系；验证已知lncRNA，预测novel lncRNA；鉴定已知circRNA的同时，预测新的circRNA及其靶标。