SMURF/5R 微生物 菌群鉴定 16s
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- 2022-11-30 17:47:30
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技术介绍：
菌种鉴定研究手段，有别于宏基因组、常规16S，有时由于微生物含量过少，多数不能满足宏基因组的建库所需DNA的量，SMURF/5R技术是扩增并测序了5段V区（68%的长度）合并分析，这个方法得到的结果接近于三代16S全长的物种分辨率。可应用于任何一组扩增子，从而实现有效的下游分析。越来越多的研究者已不满足于常规16S技术，主要原因是常规16s方法（如V3V4）仅能在属水平进行准确鉴定，所获得结果无法进一步揭示菌群在代谢和功能分类上的具体作用。寻求“种”水平分辨率鉴定已经成为各个研究领域的迫切需求。为此，一个以色列团队开发了16S多区域测序技术（SMURF/5R）。这是一个基于多重PCR技术，涵盖了16S高变区中的5个，可达到“种”水平的鉴定分辨率。SMURF/5R技术已经在CELL、Science及Nature Communication等30多篇国际权威杂志上采用，充分体现出该技术的研究热度。
适用范围：
常规组织、肿瘤、FFPE、骨骼等等
号外号外！
5R产品可以做外泌体样本了！组织，血液，唾液以及粪便样本均可！但凡做转录组项目的样本都可以加测细菌外泌体测序
号外号外！
5R产品可以做外泌体样本了！组织，血液，唾液以及粪便样本均可！但凡做转录组项目的样本都可以加测细菌外泌体测序
已应用于：
肠道微生物、生殖道微生物、肿瘤微生物、胚胎微生物、海洋微生物、口腔微生物、牛奶微生物、土壤微生物、空气微生物、尿液微生物、胃液微生物等等
优势 ：
覆盖区域长——测序覆盖了16S rDNA基因上的5个区域，约占全长的68%。
鉴定“种”多——更长的16S rDNA基因覆盖，鉴定出更多更准的菌“种”。
鉴定“种”多——更长的16S rDNA基因覆盖，鉴定出更多更准的菌“种”。
结果分析报告
