DNA甲基化（DNA methylation）为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。所谓DNA

甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明，

DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。

胞嘧啶和甲基胞嘧啶

早期对甲基化的检测，主要靠BSP、MSP等方法，低效繁杂还不准确，随着高通量测序技术的发展，高通量测序技术也可以被用在

甲基化检测领域。一般情况下，基因的启动子位置会有连续的CpG，称为CpG岛，它们通常处于非甲基化状态。相反，非CpG岛的CpG

通常都是处于甲基化修饰状态。若CpG岛发生了非正常的甲基化，那么就会导致基因表达异常降低。或者其他位置CpG降低

导致基因表达异常升高。擎科生物可提供甲基化靶向捕获测序技术，此方法适合一个到上千个靶序列的甲基化检测，使用非常灵活。

1.DNA提取：提取DNA、进行重亚硫酸盐处理，非甲基化的C都会变成U。

2.靶向捕获文库制备：将靶向区域富集之后进行捕获后扩增。U被扩增后变成T碱基。

3.文库质检：先使用 Qubit 2.0 进行初步定量，随后使用 Agilent 2100 对文库的 insert size 进行检测，insert size 符合预期后，使用 Q-PCR

方法对文库的有效浓度(2 nM)进行准确定量，以保证文库质量。

4.上机测序：根据文库的有效浓度及数据产出需求进行 Illumina Novaseq PE150 测序。

5.生物信息分析

说明：通常我们会选择基因启动子位置2000 bp范围内的CpG道进行甲基化检测；但某些情况下，导致基因表达异常的甲基化位点可能并非处于CpG

岛内。我们也可以对启动子2000 bp范围内所有CpG还有基因本体进行甲基化检测。采用捕获测序的方法也不会增加太多的研究成本。