生物体的表型由 DNA、RNA、蛋白质及代谢物等各个层面调控决定，mRNA 研究可以获得样本之间差异基因、复杂调控网络，而基因与表型不能直接关联，难以鉴定控制关键途径的结构及调控基因，结合代谢组，辅助时序表达的众多基因进行”共表达”分析，揭示基因功能，并将基因与表型关联起来，快速鉴定核心调控网络，确定关键候选基因。

分析方法

非靶向代谢组和广泛靶向代谢组是目前代谢组学常用的技术。非靶向代谢组是将对照组和实验组样本的全部代谢物进行比对，以找出其代谢物的差异。广泛靶向代谢组是高通量、高灵敏度靶向代谢物检测技术，提供了定性、定量检测大批量、低丰度代谢物效率高的方法， 有助于多方面解析差异代谢物与代谢途径。