ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化检测试剂盒
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- 新格元生物
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- 2023-11-07 09:15:57
新格元（南京）生物科技有限公司
糖基化作为一种常见的蛋白翻译后修饰，在真核细胞中广泛存在，不同细胞类型的糖基化在类型和数量上也有较强的异质性。在组织和细胞中，糖基化主要参与调控蛋白质的定位、功能和活性，影响细胞识别、分化、信号转导、免疫应答等多种重要的生命活动。糖基化异常可导致肿瘤、糖尿病、心血管和神经退行性疾病等多种病症。
ProMoSCOPE™高通量单细胞糖基化检测试剂盒，是在单细胞分辨率下同时检测单细胞转录组和细胞表面糖基化的商业化产品。基于酶促糖基化原理，在测序前经过糖基转移酶连接Tag，使用Singleron Barcode Beads可完成对单细胞Tag标签及转录组的捕获，通过标签文库及转录组的联合分析，可获得细胞转录组信息及细胞糖基化信息，有效指征细胞糖酵解和代谢水平。
1. 糖基化标记对细胞转录组数据无影响：
采用正常小鼠骨髓细胞分别进行单细胞转录组建库（Control_ M）和单细胞糖基化检测试剂盒建库(FUT_M)，两组转录组数据无明显区别。
2. 获得细胞聚类信息的同时，得到糖基化图谱信息：
在细胞图谱上映射糖基化信息，可以看到细胞类型特异糖基化丰度，进一步刻画细胞异质性。如图所示，在测试数据中细胞Neutrophils、Monocytes、HSCs、BCells、Macrophages、Basophils糖基化水平高于GMP、ProEryth、TCells。
1. 试剂组分全面：
试剂盒包含转录组建库试剂组分和糖基化标记及建库组分；无需购买额外的试剂。
2. 单细胞糖组学：
单样本同时获得单细胞转录组和糖基化信息。
3. 高覆盖率：
可在单细胞分辨率下检测到大多数糖基化事件。
本方法用重组幽门螺杆菌α1，3岩藻糖基转移酶（FucT）将带有单链DNA（ssDNA）标记的岩藻糖残基转移到LacNAc聚糖单元的N-乙酰葡糖胺（GlcNAc）的3-OH，实现了特异性聚糖信息向DNA信息的转化。通过设计ssDNA的序列将细胞表面LacNAc检测与单细胞多组学平台整合，同时获得单细胞转录组信息和LacNAc信息[1]。
[1]Yang Y, Ouyang S, Tian T, Zhao Z, Yang R, Chen M, Lauvau G, Guo Z, Wu P, Li JP. Chemoenzymatic Measurement of LacNAc in Single-Cell Multiomics Reveals It as a Cell-Surface Indicator of Glycolytic Activity of CD8+ T Cells. J Am Chem Soc. 2023 Jun 5. doi: 10.1021/jacs.3c02602. Epub ahead of print. PMID: 37276352.
