Small RNA测序

小RNA是一类长度在18-30nt的RNA分子，主要包括miRNA、siRNA和piRNA等，参与调控基因表达、生长发育、非生物胁迫和病原菌的侵害等过程。

利用第二代高通量测序技术，对特定状态下的组织的small RNA进行测序，对获得的小 RNA 序列进行分析、鉴定，同时还可以预测新的miRNA，并对鉴定出的miRNA进行靶基因预测和功能分析。

应用领域：

样本全转录本信息获取

基因注释及筛选

基因结构分析

产品优势：

技术稳定性好：技术稳定，建库稳定性好

检测精度高：几百万级深度检测，可以检测出低丰度small RNA

分析内容多方面：不仅可以分析microRNA，还可以分析siRNA

标准信息分析

1.测序数据及其质量控制：

测序碱基质量值

测序数据产出统计

2.sRNA分类注释：

ncRNA及重复序列注释

与参考基因组比对

公共及特有序列分析

3.miRNA分析：

miRNA鉴定、

miRNA碱基偏好性分析

miRNA碱基编辑分析

miRNA家族分析

4.miRNA表达量分析：

miRNA定量、

miRNA表达量总体分布

5.miRNA差异表达分析：

差异表达miRNA筛选、

差异表达miRNA聚类分析

6.miRNA靶基因预测

7.差异表达miRNA靶基因注释：

差异表达miRNA靶基因的GO分类

差异表达miRNA靶基因GO富集层次分析

差异表达miRNA靶基因的COG注释、

差异表达miRNA靶基因KEGG注释

差异表达miRNA靶基因KEGG通路富集分析

样品要求：

1.样品类型：总RNA；

2.样品浓度：总RNA浓度≥350 ng/ul；

3.样品总量：总RNA用量>6ug；

4.样品纯度： OD260/280为1.8~2.2，260nm处有正常峰值；

5.RNA完整性：总RNA 28S/18S≥1.5； Small RNA要求电泳后有单一5S条带。（距送样日最近的电泳结果）