BGiQuant高通量荧光核酸定量系统
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- 2022-07-05 15:12:14
广州进科驰安科技有限公司
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精准核酸定量大趋势与BGiQuant的诞生
核酸定量作为生命科学最常用的分析技术之一，应用领域十分广泛，包括精准医疗、基础研究、疾病诊断、刑侦、肠道微生物组学分析，生物制品核酸残留检测等。随着样品分析对通量，速度，质量要求越来越高，核酸定量技术也呈现出新的发展趋势——简易、经济、高精度、高通量。
当前，NGS高通量测序技术已普遍应用于基础研究和精准医疗等热门研究及应用领域。对NGS来说，文库质量是决定实验是否成功的最重要因素。构建文库前的核酸提取纯化与定量分析，文库制备富集后的核酸定量与质量评价，对于确保片段质量和高效获得高质量测序数据是至关重要的。
1. 精准稳定: 多项德国工艺设计保证了检测效果
整合优化的定量方案，利用长寿命高能量氙闪灯光源，核酸定量配套优化专用滤光片组，增益最精细调控光电倍增管检测器，配合行业金标准核酸定量数据采集与分析，可实现pg级核酸超灵敏高特异性精准稳定分析
2. 经济实惠: 试剂开放，选择性多
根据不同核酸类型，不同浓度区间，不同通量应用场景，可选择性价比高，灵敏度高，操作简单，精准稳定的检测试剂兼容各种主流核酸荧光定量试剂盒：
>Qubit Quantitation Dyes-ThermoFisher
>Quant-iT Quantitation Dyes- Invitrogen
>QuantiFluor Quantitation Dyes-Promega
>AccuBlue Quantitation Dyes-Biotium
>iQuant Quantitation Dyes – GeneCopoeia
>Helixyte & StrandBrite-ATT Bioques
3. 简易灵活：“Add and Read”
可为不同孔板，不同检测体系，不同检测内容，提供预设优化的标准，精准，稳定分析方案，可在不同实验室相同型号仪器上轻松实现“Add-and Read”一键点击，自动生成分析报告
BGiQuant用户可使用预设核酸（dsDNA，ssDNA，RNA，microRNA等）精准定量标准采集Protocols。各采集Protocol均可按照相应检测试剂盒，自动完成最佳条件优化，用于后续检测，实现一键点击，完成检测，自动生成分析报告。优化好的标准Protocols可在不同批次样品，不同实验室相同型号仪器之间高重复性高稳定性应用。
BGiQuant用户可使用多功能，多拷贝，符合FDA 21 CFR Part 11条款要求的MARS数据分析软件，使用预设的核酸(dsDNA，ssDNA，RNA，microRNA等)精准定量数据分析标准模版，实现一键点击，完成数据分析。各分析模版可完成平均值，标准曲线拟合，浓度计算， CV值等相关指标自动分析。分析模版可随时调用，可对批量数据自动分析。结合数据采集和分析标准模版，可实现一键点击完成数据采集，数据分析，报告升成（CSV/Text/PDF格式），自动存储等标准数据处理过程。
4. 高通量检测
高通量，易整合，自动化，经济，灵活的精准核酸定量
BGiQuant配合自动化移液工作站，可轻松实现384孔板高通量，自动化，小体积精准稳定核酸定量，为大规模样品提供经济实惠，简单易用的高通量自动化分析方案
5. 可自动化
BGiQuant可与自动化液体工作站整合，实现高通量，自动化，小体积，经济实惠，智能灵活的标准，稳定，精准核酸定量，满足大规模样品高通量自动化分析需求。
国内BMG核酸定量代表用戶
NGS全球标杆企业华大基因累计安装数十台BGiQuant 型号系列，长期以来用于大量核酸样品高通量精准定量SOP方案中。国家食品药品监督管理局直属事业单位中国食品药品检定研究院，中国肿瘤精准医疗领域先行者泛生子，专注于高通量测序靶向捕获技术的艾吉泰康，世界领先三代测序基因组中心武汉未来组以及拉索生物（基因宝）等用户均有BGiQuant 高通量，精准，稳定核酸定量方案在用。
代表文章：BGiQuant-NGS高通量，精准，稳定核酸定量代表文章
High-throughput assay for determining specificity and affinity of protein-DNA binding interactions. Nature protocols, 27 June 2006, Outi Hallikas & Jussi Taipale
Histone modifications and silencing prior to DNA methylation of a tumor suppressor gene. Cancer cell, January 2003, Kurtis EBachman, Ben HoPark, InaRhee, Harith Rajagopalan, James G Herman, Stephen B Baylin, Kenneth W Kinzler, Bert Vogelstein
A sugar phosphatase regulates the methylerythritol phosphate (MEP) pathway in malaria parasites. Nature communications, 24 July 2014, Ann M Guggisberg, Jooyoung Park, Rachel L Edwards, Megan L Kelly, Dana M Hodge, Niraj H Tolia, Audrey R Odom
High-throughput Quant-iT PicoGreen assay using an automated liquid handling system. BioTechniques, 15 May 2019, Kay Anantanawat, Nicola Pitsch, Caroline Fromont & Caroline Janitz
Evaluation of the reproducibility of amplicon sequencing with Illumina MiSeq platform.
PloS one, 28 April 2017, Chongqing Wen, Liyou Wu, Yujia Qin, Joy D. Van Nostrand, Daliang Ning, Bo Sun, Kai Xue, Feifei Liu, Ye Deng, Yuting Liang, Jizhong Zhou
External quality assessment for detection of fetal trisomy 21, 18, and 13 by massively parallel sequencing in clinical laboratories. The Journal of Molecular Diagnostics, 30 December 2015,Rui Zhang, Hongyun Zhang, Yulong Li, Yanxi Han, Jiehong Xie, Jinming Li
Preparation of high-quality next-generation sequencing libraries from picogram quantities of target DNA. Genome research, 16 November 2011, Nicholas J. Parkinson, Siarhei Maslau, Ben Ferneyhough, Gang Zhang, Lorna Gregory, David Buck, Jiannis Ragoussis, Chris P. Ponting, and Michael D. Fischer
Multiplex restriction amplicon sequencing: a novel next‐generation sequencing‐based marker platform for high‐throughput genotyping. Plant biotechnology journal, 14 June 2019, Amy Bernardo, Paul St. Amand, Ha Quang Le, Zhenqi Su, Guihua Bai
Panda, Amrita Kumari, et al. "Bacterial diversity analysis of Yumthang hot spring, North Sikkim, India by Illumina sequencing. Big Data Analytics, July 2017, Amrita Kumari Panda, Satpal Singh Bisht, Bodh Raj Kaushal, Surajit De Mandal, Nachimuthu Senthil Kumar, Bharat Chandra Basistha
Comparison and validation of some ITS primer pairs useful for fungal metabarcoding studies. PloS one, 16 June 2014, Michiel Op De Beeck, Bart Lievens, Pieter Busschaert, Stéphan Declerck, Jaco Vangronsveld, Jan V. Colpaert
Cooled propylene glycol as a pragmatic choice for preservation of DNA from remote field-collected Diptera for next-generation sequence analysis. Journal of economic entomology, 06 April 2016, H. J. H. Patrick, A. Chomič, K. F. Armstrong
Genetic Diversity, Population Structure, and Linkage Disequilibrium of Pearl Millet. The Plant Genome, 01 November 2019, Desalegn D. Serba, Kebede T. Muleta, Paul St. Amand, Amy Bernardo, Guihua Bai, Ramasamy Perumal, Elfadil Bashir
Classification and characterization of species within the genus Lens using genotyping-by-sequencing (GBS). PLoS One, 27 March 2015, Melissa M. L. Wong, Neha Gujaria-Verma, Larissa Ramsay, Hai Ying Yuan, Carolyn Caron, Marwan Diapari, Albert Vandenberg, Kirstin E. Bett
Comparative evaluation of four bacteria-specific primer pairs for 16S rRNA gene surveys. Frontiers in microbiolog, 28 March 2017, Sofie Thijs, Michiel Op De Beeck, Bram Beckers, Sascha Truyens, Vincent Stevens, Jonathan D. Van Hamme, Nele Weyens and Jaco Vangronsveld
Cryptosporidium as a testbed for single cell genome characterization of unicellular eukaryotes. BMC genomics, 23 June 2016, Karin Troell, Björn Hallström, Anna-Maria Divne, Cecilia Alsmark, Romanico Arrighi, Mikael Huss, Jessica Beser & Stefan Bertilsson
Circulating cell-free DNA, telomere length and bilirubin in the Vienna Active Ageing Study: exploratory analysis of a randomized, controlled trial. Scientific reports, 01 December 2016, Anela Tosevska, Bernhard Franzke, Marlene Hofmann, Immina Vierheilig, Barbara Schober-Halper, Stefan Oesen, Oliver Neubauer, Barbara Wessner & Karl-Heinz Wagner
技术参数
检测内容
核酸（dsDNA，ssDNA，RNA，microRNA）荧光法精准定量
检测通量
1-384个样品/次检测
检测体积
10-200μl
光源类型
长寿命高能量闪烁氙灯
检测器
低噪音超灵敏光电倍增管。检测器增益可精细手动或自动调节，调节范围：0-4095
读板次序
具有8种以上为复孔布置方向或布置位置优化的读板次序，优化检测速度和重复稳定性
读板方式
终点法、动力学；一次动力学检测，支持4个区间动力学特性，优化检测性能
顺序多激发、顺序多发射、比例测定；同批次检测，每孔支持多至8种染料同时检测
中心读数，轨道平均，椭圆平均，孔域扫描；针对高浓度或基因组核酸等样品，具有快速多点平均检测方式
震荡
微孔板震荡器可控制时间、力度和方向
支持线性，圆周和双圆周3种震荡混匀；振荡频率100～700rpm
长时程震荡加固，支持高频长时程振荡（支持700rmp100小时以上长时间连续震荡）
特有编程模式，支持灵活的样品震荡与检测自动整合
温度控制
室温+4°C到45°C，精度控制为±0.1°C；温度稳定性±0.1°C，温度均一性 <± 0.25°C
灵敏度
<0.2 fmol/孔荧光素，384孔板,20ul
动态范围
7个数量级
速度
飞行模式：7 s (96孔板)，14 s (384孔板)
稳定性
标准板标准荧光物质检测CV<1%
软件
多功能数据采集和数据分析软件5个拷贝，各拷贝均符合FDA 21 CFR Part 11条款要求
人性化软件，图像化视窗式设计，预设常用核酸数据采集和分析标准模版，可实现一键点击自动完成数据检测，
数据分析及数据报告自动导出
数据支持以 Excel，CSV，PDF，图片等数据格式进行保存
开放语言环境，支持高通量自动化检测平台优化整合；支持整合数据远端自动存储
