自免病相关的自身抗体检测-PA001 (120种抗原
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- 易锦生物
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- 2023-04-28 15:33:52
广州易锦生物技术有限公司
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免疫系统通常不会攻击人的自身机体，当自身免疫性疾病发生时，则会产生自我反应的T细胞或循环抗体，去识别宿主蛋白(也称自身抗原)。已有超过100种自身免疫疾病被发现，因此急需能够高灵敏度检测大量自身抗体的工具。 GeneCopoeia的人自免病相关的抗原芯片是一种蛋白抗原芯片，能够高效地检测与许多疾病相关的自身抗体，包括类风湿关节炎、肌肉营养不良、系统性红斑狼疮和 I 型糖尿病。该阵列包含多达120个纯化蛋白，这些蛋白被固定在玻璃载玻片上。这些蛋白均有文献综述报道并已知与特定自身免疫疾病相关。
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部分抗原信息
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lg control (hlgG+hlgM)
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alpha-actinine
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Beta2 glycoprotein 1
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Chondroltin Sulfate C
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CollagenⅠ
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CollagenⅡ
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Cytochrome C
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Histone H1
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Hemocyanin
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BPI
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LC1
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PL-7
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PL-12
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Ro/SSA(60 kD)
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Myelin basic protein (MBP)
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CD8
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数据分析
GeneCopoeia的抗原芯片检测服务含简要数据分析。阵列扫描后，使用GenePix®7.0软件收集和分析原始数据。数据分析包括数据归一化、差异分析、聚类分析，以及按变化水平排列的每个抗原的热图。我们的分析按照以下步骤： 1. 收集原始数据。扫描后，在Excel文件中收集原始信号强度，如下所示。
2. 然后，将原始数据用参照点的值进行归一化，并将净信号强度(Net Signal Intensity, NSI)值以及信噪比(signal-to-noise ratios, SNRs)列在一个Excel文件中。
3. 标准分析的最后一步是确定“抗体评分”，即样品中给定抗体的相对富集程度。抗体评分以数字形式展示，并显示在热图中。得分越高(在热图上向红色移动)表明抗体-抗原相互作用越强，如下例所示：
4. 除标准数据分析包外，客户还可以选择定制数据分析服务。其中一项服务是使用基因本体（ Gene Ontology, GO）分析对阵列上的阳性抗原进行分类，该分析基于已知的生物功能对基因和蛋白质进行分类。分子功能GO分析的读数示例如下所示：
此外，生物过程的GO分析如下示例所示：
5. 另一个广泛用于生物信息分析的工具是KEGG (Kyoto Encyclopedia for Genes and Genomes) 通路分析，我们使用该工具根据已定义的生物通路对阳性抗体-抗原相互作用进行分组，如下所示：
服务流程
样本要求
1. 适用于自身抗原芯片检测的常见样品
血浆、血清、淋巴、尿液、间质液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等体液均可用于自身抗原芯片检测分析。
2. 样品的收集方法
a. 血清：采用不含抗凝剂的采血管采集全血，4℃放置30-45min后，4℃ 3000rpm离心10min，取上清，存于-80℃冰箱；
b. 血浆：采用抗凝剂的采血管采集全血，4℃放置30-45min后，4℃ 3000rpm离心10min，取上清，存于-80℃冰箱；
c. 尿液：收集不添加稳定剂的尿液样本后，4℃ 10000rpm离心1min或5000rpm离心2min，取上清，在干冰/甲醇浴中快速冷冻，储存在-80℃备用。
3. 样本量
为保证实验的顺利进行，体液样本的样本量请≥50 ul。
4. 样本寄送要求
a. 快递发出后请于当天将快递单号或专业化冷链物流托运单号及时告知乙方；
b. 收货后乙方会对样品到达状态拍照，若样本送达状态不佳，可能需重新寄送；
c. 体液样本请优先保存于干冰中寄出，干冰用量需足够以确保寄到时仍有干冰剩余；
血浆、血清、淋巴、尿液、间质液、渗出液、细胞溶解液、分泌液等体液均可用于自身抗原芯片检测分析。
2. 样品的收集方法
a. 血清：采用不含抗凝剂的采血管采集全血，4℃放置30-45min后，4℃ 3000rpm离心10min，取上清，存于-80℃冰箱；
b. 血浆：采用抗凝剂的采血管采集全血，4℃放置30-45min后，4℃ 3000rpm离心10min，取上清，存于-80℃冰箱；
c. 尿液：收集不添加稳定剂的尿液样本后，4℃ 10000rpm离心1min或5000rpm离心2min，取上清，在干冰/甲醇浴中快速冷冻，储存在-80℃备用。
3. 样本量
为保证实验的顺利进行，体液样本的样本量请≥50 ul。
4. 样本寄送要求
a. 快递发出后请于当天将快递单号或专业化冷链物流托运单号及时告知乙方；
b. 收货后乙方会对样品到达状态拍照，若样本送达状态不佳，可能需重新寄送；
c. 体液样本请优先保存于干冰中寄出，干冰用量需足够以确保寄到时仍有干冰剩余；
