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CRISPRclean High Expressing RNA Depletion Kit
CRISPRclean High Expressing RNA Depletion Kit
  • KIT1020
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  • 2023-04-11 12:03:13

北京赛百盛基因技术有限公司

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最大化低表达转录本,使用我们广泛的RNA去除面板

我们的 CRISPRclean High Expressing RNA Depletion Kit 在测序前在体外去除最高表达的转录本,将约70%*的测序读长(reads)重新分配给唯一的生物学相关转录本,从而最大化检测低表达的转录本或罕见的亚型。

 

提高对成纤维细胞和全血中的检测灵敏度

 

重新测序高表达的转录本对生物学相关信息的贡献较小。不幸的是,这些转录本会在测序过程中占据优势,从而限制了对低表达基因、罕见变异和独特融合事件的检测。此外,高表达转录本引入的噪声也会影响检测结果。

CRISPRclean利用Cas9和一组 guide RNA,从从成纤维细胞和全血中选择的poly-A富集的RNA-Seq文库中去除70%的最高表达转录本。这组 guide RNA 被设计用于最大化将总的测序读长重新分配到罕见的低表达转录本和独特的融合事件,从而增加测序覆盖度。

 

 

关于

  • CRISPRclean High Expressing RNA Depletion Kit 包括 guide RNA和去除试剂,用于文库制备后的去除步骤。

  • CRISPRclean RNA Prep HMR (KIT1014) 兼容。

 

 

 

 

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对于较低表达的转录本,对其测序读长的覆盖度提高了约5倍

 

 

 

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技术文档

tech-note-high-expressing-rna-depletion-102022-v1.pdf

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