目标区域捕获甲基化测序
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- 2022-12-01 10:29:19
合肥麟美生物科技有限公司
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甲基化多态性是个体表型差异的重要原因,甲基化变异也可能导致个体表型异常。已有大量研究表明甲基化异常和癌症,糖尿病,帕金森等复杂疾病密切相关,甲基化检测对生物学、转化医学等研究具有重要意义。基于芯片以及二代测序平台,已有多种实验方法能够用于全基因组甲基化检测,包括Illumina850K甲基化芯片,WGBS(Whole-genomebisulfitesequencing,全基因组重亚硫酸盐测序),RRBS(Reducedrepresentationbisulfitesequencing,简化基因组重亚硫酸盐测序)等。而针对特定位点/区域的甲基化检测,目前仍多通过传统方法,如MSP(Methylation-specificPCR,甲基化特异PCR)和BSP(Bisulfite-SequencingPCR,甲基化PCR测序)的方法实现,通量小,成本高,且无法准确计算位点/区域的甲基化水平。
目标区域捕获甲基化测序利用多重PCR的技术,结合二代测序平台,实现对多个特定CpG岛同时捕获测序,并凭借高深度测序数据,能够准确计算每个CpG位点的甲基化水平。该技术准确性高,灵活性强,性价比优,为DNA甲基化研究提供有效的实验工具。