CRRSPR/Cas9基因敲除系统之sgRNA设计
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- 上海睿远生物
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- 2022-05-05 16:45:32
上海睿远生物医药科技有限公司
近年来,CRISPR-Cas9系统被不断改进,已逐渐成为适用于各类生物基因编辑的强大工具。无论是在DNA水平上进行单碱基编辑、小片段缺失、突变,还是在RNA水平上转录调控RNA、实现RNA干扰,或是基于表观遗传学调控DNA甲基化等各方面的研究,都给科研工作者带来极大的便利。
CRISPR-Cas9 sgRNA文库结合高通量筛选技术具有广泛的应用,既可以在全基因组范围筛选发现新靶点,还可以快速准确地找到与某种表型相关的基因或基因群。世界顶级期刊Cell、Nature、Science等竞相持续报道,sgRNA文库在药物发现、基因功能研究、分子诊断、疾病治疗、作物育种等领域均发挥了重要作用[1-3]。
睿远生物CRISPR-Cas9
sgRNA文库设计和构建
睿远生物的CRISPR-Cas9平台可提供一站式基因编辑解决方案,高效助力全基因组范围内的基因编辑。我们的一站式服务主要包括sgRNA设计合成、文库构建、NGS验证、病毒包装、生信分析等。
sgRNA文库设计
合理、高效的sgRNA文库设计是进行基因组/代谢通路编辑的重要前提。目前,睿远生物已成功完成200+sgRNA文库设计与构建,覆盖了动物、植物、微生物中20+种模式物种。我们的设计类型包含敲除文库、激活文库和干扰文库等。客户只需要提供物种的基因名称/ID和设计需求,睿远生物将为您定制化高质量、高编辑效率的sgRNA产品
sgRNA文库优势显著:
●应用范围广,不受基因序列、细胞和物种的限制
●可快速准确找到与某种表型相关的基因与基因群
●可用于全基因组范围筛选,有利于新靶点发现
●编辑效果假阳性比率较低,靶点命中率高
sgRNA文库构建
我们可根据客户特定需求,针对全基因组/代谢通路设计并合成sgRNA序列(图1),然后对sgRNA序列进行PCR扩增,将扩增后的sgRNA克隆到载体中构建sgRNA文库,最后经过NGS测序验证,交付库容、正确率、覆盖度、均一性等符合标准的sgRNA文库。
图1:sgRNA文库构建流程
sgRNA文库筛选
睿远生物的定制化sgRNA文库产品,可满足客户多样化的高通量筛选需求(图2)。如利用sgRNA文库建立哺乳动物全基因组突变库或与某类功能相关的基因突变体库,通过功能性筛选、富集、PCR扩增和深度测序分析,可发掘并筛选出与表型相关的基因。