全基因组重测序
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- 2022-12-01 10:00:17
合肥麟美生物科技有限公司
全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)在动植物的研究中对于重要性状特别是复杂形状的定位有着快速、准确的优点。基于高通量测序对某种农作物或禽畜的代表性品种、地方种或野生种进行基因分型,结合准确的表型数据可对农作物或禽畜重要复杂性性状进行定位。特别是在包含了野生种、驯化种和改良种的群体中,结合群体进化分析对收到驯化和改良的重要基因进行定位,是研究作物或禽畜微进化及驯化改良表型的重要思路。
应用领域
全基因组范围内多性状的定位;
目标性状的生物学基础研究。
产品优势
高通量检测全基因组SNP并进行关联分析,扫除定位盲点;
重重筛选SNP,多重检验显着性,保证结果准确性;
同时对多种性状进行定位;
定位精度至多可达单基因水平。
标准信息分析
已有参考基因组序列的动植物自然群体;
样本间无明显的亚群分化(如生殖隔离等);
所研究表型性状遗传力较强。
≥200个样本;
基于SNP:≥5 X/个体;
基于CNV:≥30X/个体 10~20W Tags;
平均8 X/Tag;
测序数据质量评估;
与参考基因组比对;
、CNV检测及注释 SNP检测及注释;
高级信息分析
构建系统进化树;
群体主成分分析;
连锁不平衡分析;
性状关联分析;
目标性状相关区域基因功能注释;
构建单体型图谱。
样品要求
样品类型:基因组DNA;
样品需求量:单次2 ug;
样品浓度:文库≥30 ng/μl;
样品纯度:OD260/280为1.8-2.0;
电泳要求:主带清晰,无降解或轻度降解。(距送样日最近的电泳结果)