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基于噬菌体免疫沉淀测序(PhlP-seq)全景观抗体反应谱构建定制化服务
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所在地
上海市
发布时间
2025-04-21 16:01:45
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概 述

噬菌体免疫沉淀测序(Phage immunoprecipitation sequencing,PhlP-seq)技术是近年来新兴的一项高通量筛选的技术,联合高容量的噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀以及高通量测序技术,可针对数十万种抗原进行血清抗体检测,构建全景观的抗体反应谱。

技术原理

文库构建
针对任意蛋白质集合,构建理性设计(rational design)、可编程(programable)、全表位覆盖的噬菌体展示肽库。

抗体筛选
将含有抗体的样本(如血清、血浆、脑脊液、羊水、肺泡灌洗液以及外泌体等)与噬菌体展示抗原库共孵育,并通过免疫沉淀的方式富集抗体-抗原(噬菌体)复合物。
数据解析
将富集的噬菌体进行高通量测序,获得每一样本中抗体所识别的多肽和蛋白抗原的集合

我们具有多种ready-to-use的噬菌体展示肽库(抗原库)

应用场景

应用介绍:生物标志物的发现-临床研究的关键课题

生物标志物对于疾病诊断、治疗和个体化医疗至关重要。PhIP-seq技术可同时检测数十万种抗原的抗体反应,实现全蛋白组级别的抗体组学分析,发现疾病相关的抗体响应特征,是生物标志物发现研究的有力工具。

研究思路

生物标志物研究通常为经典的Case-ControlStudy范式,基于一定数量的样本筛选,统计分析获得疾病特异性的生物分子,并进行独立样本的验证。标志物研究亦可采用机器学习等算法建立组合或数学模型。

相关疾病

自身免疫性疾病、肿瘤、神经免疫性疾病、感染性疾病、心血管、肾病、呼吸道疾病、消化道疾病等广泛疾病类型。

经典研究

应用介绍:分子模拟的研究感染和自身免疫的桥梁

自身免疫往往与感染有关,而分子模拟(molecular mimicry)是其重要的作用机制之一。PhiP-seg技术可构建自身免疫谱和病毒/细菌等微生物抗体谱,在表位水平描述交叉识别特征,是研究分子模拟的极佳工具。

研究思路

根据模拟表位(mimicepitope)的特点(表位相似、竞争结合),可针对同一样本队列,同时构建自身抗体谱和微生物(病毒或细菌等)抗体谱,通过差异分析、联合分析以及表位相似性分析,可快速锁定潜在模拟表位。后续可通过竞争性实验和其它功能性实验加以确认。

相关疾病

(类)自身免疫性疾病、神经免疫性疾病、感染性疾病、肿瘤等疾病,并广泛应用于任何感染-免疫紊乱相关疾病的机制研究和靶点发现。

经典研究

应用介绍:病因学研究 /风险因素评估

病因学研究是探究疾病发生原因和发病机制的科学领域,旨在明确引发疾病的各类因素,以及这些因素如何相互作用导致疾病出现和发展。PhlP-seq技术可构建全景观病毒/细菌抗体反应谱,具有长期记忆印记和具备可回溯性,对于探索疾病病因具有重要价值。

研究思路

基本思路同生物标志物研究,即基于 经典 的Case-Control Study范式,分析疾病组中特异性的抗体及其所识别的抗原(微生物),以便挖掘疾病表型背后的内在规律。

相关疾病
感染性疾病、慢性炎症等不明病因的疾病,以及探究各类疾病的风险因素,如妊娠感染和胎儿异常、感染和心血管疾病。

经典研究

应用介绍:疫苗研究全面评价优势免疫原蛋白/表位

疫苗通过激发人体的免疫反应,使机体产生对特定病原体的抵抗力,疫苗研究与接种对预防疾病的发生和传播具有重要意义。借助PhlP-seq技术,可同时对多种潜在免疫原进行检测,快速鉴定优势抗原,为后续疫苗研究奠定坚实基础。

研究思路

针对所研究的病原微生物,定制蛋白质组全覆盖的噬菌体展示抗原库,筛选临床来源或实验动物的血清样本,进而全面刻画其体液免疫图谱,发现具有高度免疫原性的蛋白质及其表位。

相关疾病

流感、冠状病毒、金黄色葡萄球菌、肠道病毒、百日咳杆菌等感染性疾病的疫苗研究。

经典研究

应用介绍:公共卫生免疫监测预警疫情
免疫监测在维持人体健康、疾病诊断与治疗以及公共卫生防控等方面都具有至关重要的作用。在公共卫生层面,检测突发样本抗体免疫反应,为潜在疫情风险提供预警;在个人健康管理层面,监测健康人群抗体反应的动态变化,不仅能精准确定个体的“免疫年龄”,还能深入建立抗体基因、公共表位与免疫个体差异之间的内在联系。基于PhIP-seq技术,以一种快速、高效且高通量的方式,对数十万种抗体进行全面监测,无疑为免疫监测领域注入新的活力。
相关疾病
用于公共卫生疫情监测、免疫衰老评价等。

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