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代谢组学必须要知道的那几件事儿

发布时间:2023-02-13 11:40:58 I 企业名称:苏州金纬标检测有限公司 I 作者:
代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一个生物或者细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物,代谢组学则是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。
然而,代谢组学毕竟兴起的时间短,许多小伙伴对其还不这么了解,小编就收到了许多老师关于代谢组学方面的疑问,小编在这里将这些问题进行了整理, 希望能对小伙伴们有所帮助。话不多说,让我们直接进入正题吧!
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什么情况下选择代谢组学?
代谢组学(Metabonomics or Metabolomics) 代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。之后得到迅速发展并渗透到多项领域,比如疾病诊断、营养食品科学、毒理学、环境学,植物学等与人类的健康护理密切相关。基因组学和蛋白质组学分别从基因和蛋白质层面探寻生命的活动,而实际上细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,如细胞信号释放(cell signaling),细胞间通信等都是受代谢调控的。
代谢组学该选择什么平台?
代谢组学的技术平台主要分为NMR、GC-MS、LC-MS。
NMR核磁共振技术,是磁矩不为零的原子核,在外磁场作用下自旋能级发生塞曼分裂,共振吸收某一定频率的射频辐射的物理过程。
GC-MS全称是气相色谱质谱,载气推动复杂分析物,经气相色谱分离,进入到高真空质谱系统的离子源进行离子化。根据不同碎片离子在电磁场的不同运动行为,按质荷比(m/z)排列得到质谱信号,进而实现代谢物的定性定量。
LC-MS全称液相色谱质谱。样品在色谱部分和流动相分离,被离子化后,经质谱的质量分析器将子母离子碎片按质量数分开,经检测器得到化合物质谱信息,进而得到代谢物的定性定量结果。
GC-MS和LC-MS技术结合了色谱良好的分离能力和质谱的普适性、高灵敏度以及专一性,是目前做代谢组学常用的技术平台。但是目前为止没有任何一个检测平台能够同时检测样本中所有的化合物,只能通过选择性的提取结合各检测平台的并行检测来解决。因此在选择平台时应结合自身样本情况与个体需求,综合考虑。
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做代谢组学选取什么类型的样本? 样本如何处理?
一般而言,代谢组学样本的类型多种多样,常见的有以下几大类:血清、血浆、尿液、粪便、细菌、组织、植物的花、茎、叶等。老师们可根据自己的研究目的选取合适的样本进行实验。
代谢研究的样本处理和采集要遵循“保持最鲜活状态”的原则,采集样本后立即通过置于液氮、干冰或者-80°C冰箱中,阻止样本离体后的进一步代谢活动,并保证样本在实验前一直处于-80°C以下。
同一个实验的样品可不可以分成两批检测?
建议最好不要分成两批检测,因为这两个时间点仪器的响应是会发生变化,这样可能导致的问题是一些含量低的物质可能只在一个批次里被检出的到,这样导致最终的结果不准确,我们应当尽可能的减少人为因素以及仪器对实验结果的影响。
每组样本的生物学重复个数一定要一致吗?
每组样本的生物学重复的个数不一致也是可以的,但最好相差不要太多,差别不要超过2/3就可以了。相比较而言,每组生物学重复的数量足够多是更为重要的。

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