靶点鉴定平台|礼达先导PAL-AfBPP技术
礼达PAL-AfBPP技术介绍
礼达先导是中国唯一也是国际上率先利用光亲和标记的化学蛋白组学(Photoaffinity Labeling – Affinity-Based Protein Profiling ,PAL-AfBPP)技术提供活性药物靶点鉴定的商业化平台,已经与多家科研机构和制药公司建立商业化服务和合作。
化学蛋白质组学目前主要有两种技术路线:一类是基于亲和性的蛋白质组分析(Affinity-based Protein Profiling, AfBPP),一类是基于活性的蛋白质组分析(Activity-based Protein Profiling, ABPP):
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ABPP技术适用于共价化合物的靶点鉴定,能够标记的蛋白质数量有限,是含有Cysteine,Lysine和Methionine等少数活性氨基酸的蛋白质(大约占人类蛋白质组的20%左右);ABPP能够标记的蛋白质种类也通常限于Hydrolases,Kinases,Metalloproteinases和Glycosidasases几种家族的蛋白质;ABPP技术路线通常利用片段型的共价型分子进行靶点发现,但后期活性分子的结构优化具有挑战性;
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礼达先导的PAL-AfBPP技术路线适合于非共价、共价、多肽、PROTAC、分子胶等各类小分子活性化合物的靶点鉴定,并且可以标记几乎所有人类蛋白质组的蛋白以及涵盖所有功能的蛋白质家族;PAL-AfBPP技术通常从表观筛选的活性分子出发,可以获得靶点和与靶点结合区域信息,加速后期活性分子的结构优化。
礼达先导PAL-AfBPP技术在人类活细胞层面,同时定性和定量检测活细胞中几乎所有的药物 - 蛋白质相互作用,揭示活性分子和药物的生物机制(MoA),并可获得药物-蛋白质结合位区域信息,揭示潜在脱靶毒性(Toxicity)和发现新适应症的新靶点(Novel Targets)。PAL-AfBPP技术无需标记或修饰蛋白质,并可富集天然低丰度蛋白,提供了难成药靶点的突破性解决方案,例如难从细胞分离纯化并保持活性的靶点,没有晶体结构的靶点,没有已知与小分子结合区域的靶点,以及蛋白-蛋白相互作用机制的靶点。
礼达 PAL-AfBPP 技术流程
案例:EGFR药效团衍生探针的靶点和位点鉴定
发表在 Chem. Comm, 2022, 58, 9532-9535
案例:位点鉴定中结合区域热图
PAL-AfBPP 领域文献
Nature Methods, 2013, 10, 259–264
Chem. Commun., 2017, 53, 8671−8674
ACS Cent. Sci. 2017, 3, 501−509
Chem. Eur. J. 2019, 25, 12644−12651
ACS Chem. Biol. 2020, 15, 325−333
Chem. Commun., 2022, 58, 9532
关于我们
宁波礼达先导生物技术有限公司于2017年成立,是中国首家、世界首批掌握突破性化学蛋白组学技术的生物技术公司,公司同时拥有成熟的生物技术自动化设备开发和已验证的产品化能力。礼达先导以引领新药发现的数字化变革为使命,致力于建立基于人类活细胞的靶点鉴定自动化和全球领先的靶点-配体大数据平台,建立世界领先的自动化和数字化驱动的创新药物发现平台。
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